Susunan organisasi Dinas Ketahanan Pangan, Pertanian danPerikanan terdiri dari :

1. Sekretariat terdiri dari :
   1. Sub Bagian Perencanaan dan Pelaporan;
   2. Sub Bagian Keuangan;
   3. Sub Bagian Umum dan Kepegawaian.
2. Bidang Tanaman Pangan dan Hortikultura terdiri dari :
   1. Seksi Tanaman Pangan;
   2. Seksi Hortikultura;
   3. Seksi Perlindungan dan Pemasaran Hasil Tanaman Pangan dan Hortikultura.
3. Bidang Peternakan terdiri dari :
   1. Seksi Penyediaan dan Pengembangan Sarana Peternakan;
   2. Seksi Usaha Produksi dan Pengolahan Hasil Peternakan;
   3. Seksi Pengendalian Kesehatan Hewan dan Kesehatan Masyarakat Veteriner.
4. Bidang Perikanan terdiri dari :
   1. Seksi Pengelolaan Budidaya dan Tangkap;
   2. Seksi Pengolahan Pemasaran Hasil Perikanan;
   3. Seksi Pemberdayaan dan Pengawasan Perikanan.
5. Bidang Perkebunan terdiri dari :
   1. Seksi Produksi Perkebunan;
   2. Seksi Pengolahan dan Pemasaran Hasil Perkebunan;
   3. Seksi Perlindungan dan Perbenihan Tanaman Perkebunan.
6. Bidang Ketahanan Pangan terdiri dari :
   1. Seksi Pengelolaan Sumber Daya Ekonomi Kedaulatan dan Kemandirian Pangan;
   2. Seksi Peningkatan Diversifikasi dan Ketahanan Pangan Masyarakat;
   3. Seksi Penanganan Kerawanan dan Pengawasan Keamanan Pangan.
7. Bidang Penyediaan, Pengembangan Prasarana dan Penyuluhan Pertanian terdiri dari :
   1. Seksi Prasarana, Sarana dan Pengelolaan Lahan Pertanian;
   2. Seksi Pembangunan Prasarana Pertanian;
   3. Seksi Penyuluhan Pertanian.
8. Unit Pelaksana Teknis Daerah (UPTD); dan
9. Kelompok Jabatan Fungsional.